جریان اصلاحات و سیدحسن خمینی رابطه خوبی دارند. هر چند یادگار امام رسما عضو هیچ گروه و حزبی نیست، اما روابط نزدیکش با شخصیتهای برجسته جریان اصلاحات بهویژه سیدمحمد خاتمی باعث شده تا بسیاری او را از جمله اصلاحطلبان بشناسند. نام سیدحسن خمینی، اما حالا در شرایطی مطرح میشود که به نظر میرسد احزاب اصلاحطلب برای رسیدن به کاندیدای واحد چالشهایی جدی پیشرو دارند.